PT. Jembatan Nusantara menyediakan 2 layanan utama pelayaran, yaitu :

• Moda Angkutan Laut Jarak Dekat yang meliputi 30 wilayah di Indonesia
• Moda Angkutan Laut Jarak Jauh yang menjangkau sudut barat hingga sudut timur wilayah Nusantara

Setiap penumpang juga dapat menggunakan layanan kelas pelayaran yang telah disesuaikan dengan kebutuhan perjalanan.